Разработка диагностической тест-системы для быстрого выявления и оценки антибиотикорезистентности уропатогенных энтерококков
Научное направление: клинические исследования в микробиологии
2 место
Проект представил: Пушилина Алена Денисовна
Авторы: Пушилина Алена Денисовна
Коменкова Татьяна Сергеевна
Научный руководитель: Зайцева Елена Александровна, д.м.н., доцент, заведующая кафедрой микробиологии и вирусологии ФГБОУ ВО ТГМУ Минздрава России.
Организация: Тихоокеанский ГМУ
Актуальность, научная новизна:
В последние десятилетия отмечается устойчивый рост доли энтерококков среди возбудителей инфекционных осложнений в стационаре. Они являются одной из основных причин инфекций мочевых путей, бактериемии, эндокардита, инфекции органов таза и постоперационных, катетер-ассоциированных инфекций. Особую тревогу вызывает появление ванкомицин-резистентных энтерококков, которые отнесены специалистами ВОЗ к патогенам группы ESKAPE, получившим свойство «ускользать» от действия современных антибиотиков.
В настоящее время для лечения осложненных инфекций энтерококковой этиологии часто используют комбинации из препаратов, влияющих на клеточную стенку бактерии (например, пенициллин, ампициллин, амоксициллин, пиперациллин, а при тяжелых и жизнеугрожающих состояниях -ванкомицин), и аминогликозида (например, гентамицин, стрептомицин), к которым у энтерококков быстро формируется устойчивость.
Точность, скорость и своевременное определение чувствительности к антимикробным препаратам может сыграть решающую роль в успешности лечения. В настоящее время существуют методы, позволяющие оценить устойчивость E. faecalis и E. faecium к антимикробным препаратам: диффузионный метод, метод последовательных микроразведений в жидкой или плотной питательной среде (ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010), Е-тесты, хромогенные среды для выявления ванкомицин-резистентных энтерококков (CHROMagar VRE, Франция, HiCrome, Индия, ChromID® VRE,Франция), молекулярно-генетические методы (тест «Xpert vanA/vanB», предназначенный для выявления только генов vanA/vanB в образцах ректальных и перианальных мазков у пациентов с риском колонизации кишечника ванкомицин-устойчивыми штаммами бактерий).
Наш проект предлагает новый способ быстрой идентификации и выявления резистентности к антимикробным препаратам уропатогенных энтерококков с помощью диагностической тест-системы на основе современной технологии петлевой изотермической амплификации (LAMP). Технология основана на молекулярно-генетической идентификации энтерококков и выявлении генов резистентности к антимикробным препаратам, применяемым в клинической практике при терапии энтерококк-ассоциированных инфекций.
Использование тест-системы на основе технологии петлевой изотермической амплификации (LAMP) позволит: 1) выявить энтерококки в биоматериале; 2) сократить время диагностики резистентных энтерококков по сравнению с бактериологическими методами и стандартной ПЦР, 3) выбрать врачу правильную тактику при лечении инфекционного процесса, вызванного данным микроорганизмом, 4) провести мониторинг антибиотикорезистентности в стационаре.
Практическая значимость:
Итоговый результат работы - диагностическая тест-система, предназначенная для быстрой идентификации и выявления в устойчивости к антимикробным препаратам энтерококков (E. faecalis и E. faecium) в образцах мочи пациентов при инфекции мочевых путей.
Разработанный образец позволит при исследовании образцов мочи пациента в течение 1,5 часов идентифицировать уропатогенные энтерококки, получить данные о их резистентности и механизмах устойчивости, что позволит ускорить процесс выбора рациональной антимикробной терапии при инфекции мочевых путей.
Результаты, полученные в работе, могут быть использованы в клинико-диагностических, бактериологических лабораториях лечебно-профилактических учреждений, учреждениях Роспотребнадзора для эпидемиологического мониторинга за возбудителем, а также в научно-исследовательских целях.
Принимать решение о покупке набора будут заведующие клинико-диагностических и бактериологических лабораторий. Конечный пользователь – врач клинической лабораторной диагностики, врач-бактериолог, лаборант ПЦР лаборатории.